Dalam Peningkatan mutu Pendidikan, riset, dan pengabdian, Prodi Pendidikan Biologi UMM telah menjalin Kerjasama secara langsung melalui Implentation Agreement (IA) dengan berbagai Pihak baik dari dalam negeri dan luar negeri, meliputi:

Dalam Negeri:

1. Program Studi Biologi, Universitas Jendral Soedirman, Purwokerto
2. Program Studi Biologi, Universitas Ahmad Dahlan, Yogyakarta
3. Program Studi Pendidikan Biologi, IKIP Budi Utomo, Malang
4. Program Studi Pendidikan Biologi, Universitas Muhammadiyah Surabaya
5. Program Studi Pendidikan Biologi, Universitas Muhammadiyah Sukabumi
6. Program Studi Pendidikan Biologi, Universitas Muhammadiyah Kupang
7. Perusahaan aKancatani Group, Sumenep

Luar Negeri:

1. Program Studi Bioteknologi, Ho Chi Minh City Open University, Vietnam